Đánh giá đa dạng di truyền 25 dòng/giống mãng cầu xiêm và 07 dòng/giống thuộc 04 loài khác cùng họ Mãng cầu được thực hiện bởi 41 mồi/chỉ thị ISSRs. Kết quả cho thấy, có 39/41 mồi khuếch đại và nhân bản được 256 băng DNA, trong đó có 228 băng đa hình (đạt trung bình 88,23%). Trung bình giá trị thông tin đa hình (PIC) của các mồi là 0,32. Chỉ số đa dạng di truyền theo Shannon (Ia) của từng mồi ISSR dao động thấp nhất từ 0,13 (mồi 885) đến cao nhất là 0,61 (mồi 812) và có giá trị trung bình là 0,34. Biểu đồ hình cây của 32 mẫu thể hiện mối quan hệ di truyền chia làm 5 nhóm chính có hệ số tương đồng di truyền từ 0,63 đến 0,96 (trung bình là 0,78).