Bệnh xuất huyết (Motile Aeromonas Septicemia - MAS) do Aeromonas hydrophila và A. dhakensis gây ra là một trong những bệnh nguy hiểm trên cá tra. Việc lựa chọn chủng giống vi khuẩn để sản xuất vắc xin bất hoạt mang ý nghĩa quan trọng  trong phòng bệnh này. Tuy nhiên, tiêu chí lựa chọn chủng có khả năng tạo bảo hộ chéo giữa hai loài để phát triển vắc xin bất hoạt toàn tế bào vẫn chưa được xác lập. Nghiên cứu này nhằm đề xuất tiêu chí lựa chọn chủng giống dựa trên sự kết hợp giữa đánh giá độc lực, phân tích hệ gen và hồ sơ protein màng ngoài, đồng thời xác nhận hiệu quả bảo hộ bằng thử nghiệm trên cá tra. Kết quả cho thấy, chủng A. dhakensis CXD172 thuộc nhóm chưa xác định (STNF), được lựa chọn làm chủng giống sản xuất vắc xin nhờ có hồ sơ protein màng ngoài chia sẻ với A. hydrophila ST251 và A. dhakensis ST656. Đồng thời, vắc xin bất hoạt từ chủng này cho hiệu quả bảo hộ đối với cả gây nhiễm cùng loài A. dhakensis AD09 và gây nhiễm khác loài A. hydrophila AH12, với RPS lần lượt là 80,0% và 76,92%. Nghiên cứu này cung cấp cơ sở ban đầu cho việc sàng lọc và lựa chọn chủng giống có tiềm năng phát triển vắc xin bất hoạt phòng MAS.