Nghiên cứu được thực hiện nhằm đánh giá đa dạng di truyền và xác định chỉ thị phân tử phục vụ nhận dạng giống hồ tiêu (Piper nigrum L.), góp phần hỗ trợ công tác quản lý, bảo tồn và bảo hộ giống. Thí nghiệm tiến hành trên 33 mẫu giống trong vườn tập đoàn, kết hợp mô tả đặc điểm hình thái và phân tích SSR với 32 cặp mồi. Kết quả khảo sát hình thái cho thấy sự khác biệt giữa các giống về màu sắc chồi non, dạng phiến lá và mép lá, hình dạng gốc lá, cấu trúc gié và cách sắp xếp quả. Trong 32 mồi SSR, có 20 mồi đa hình, tạo ra 89 alen (trung bình 4,45 alen/mồi) với chỉ số PIC dao động 0,21 - 0,82 (trung bình 0,64). Phân tích cây phát sinh chủng loại chia tập đoàn hồ tiêu thành 6 nhóm chính, phản ánh mối liên hệ giữa quan hệ di truyền và nguồn gốc địa lý. Năm chỉ thị SSR (BPssr1, BPssr13, BPssr19, PNB5, BPssr27) cho khả năng nhận dạng đặc hiệu một số giống (DP6, TAD14, TAD15, NT1, A9, P4), nâng cao độ chính xác trong định danh và xác thực giống hồ tiêu.