Nghiên cứu nhằm nhận diện các gen liên quan đến tính trạng chống chịu sâu bệnh, điều kiện bất thuận và chất lượng gạo trong quần thể gồm 100 dòng lúa F₄ từ tổ hợp lai (OM44*2/Tẻ Tép)/(OM44*2/Rathu Heenati). Sáu chỉ thị phân tử được sử dụng để phát hiện các gen Bph17 (kháng rầy nâu), Pik-h và Pita (kháng đạo ôn), Saltol (chịu mặn), Wx (hàm lượng amylose) và fgr (mùi thơm). Kết quả cho thấy sự phân bố đa dạng của các gen mục tiêu; nhiều dòng tích hợp đồng thời nhiều gen, đặc biệt các dòng D27, D43, D61 mang cả 6 gen mục tiêu (Bph17, Bph18, Pik-h, Saltol, Wx và fgr). Nghiên cứu này khác với các nghiên cứu trước ở điểm đánh giá đồng thời nhiều gen trên cùng một quần thể, qua đó tăng hiệu quả chọn lọc. Kết quả cung cấp nền tảng di truyền quan trọng cho chương trình chọn giống lúa ứng dụng chỉ thị phân tử, hướng đến phát triển các giống lúa có khả năng chống chịu cao và chất lượng tốt, thích nghi với điều kiện vùng đồng bằng sông Cửu Long (ĐBSCL).