Lây nhiễm nhân tạo virus kết hợp với phát hiện gen kháng bằng chỉ thị phân tử sẽ giúp xác định được các vật liệu kháng virus. Lây nhiễm nhân tạo virus xoăn vàng lá cho 54 dòng thuần cà chua đã thu được 19 dòng kháng có tỷ lệ cây bệnh dao động từ 0-20% sau 90 ngày lây nhiễm. Sử dụng chỉ thị TG302 phát hiện gen kháng Ty2 và P6-25 cho gen Ty3 trên 19 dòng này thấy rằng các dòng RTY16, RTY25, RTY37 và RTY45 chứa đồng thời 2 gen Ty2 và Ty3 ở trạng thái đồng hợp tử trội đều không có cây bệnh. Ở 14 dòng RTY3, RTY5, RTY14, RTY17, RTY18, RTY19, RTY24, RTY26, RTY27, RTY30, RTY34, RTY44, RTY50, RTY54 với tỷ lệ cây bệnh từ 5,0% tới 20% đều chưa thuần về gen kháng, trong đó các cá thể bị bệnh đều mang kiểu gen đồng hợp tử lặn ty2/ty2; ty3/ty3. Riêng dòng cà chua RTY49 cần kiểm tra với chỉ thị của gen khác bởi chúng đồng hợp tử lặn của cả 2 gen trên nhưng hoàn toàn không có triệu chứng bệnh.