Trong những năm qua, Trung tâm Nghiên cứu Cây ăn quả và Cây công nghiệp Phủ Quỳ đã thu thập, bảo tồn và đánh giá được nguồn gen cây trồng địa phương rất đa dạng và phong phú. Từ năm 2011 - 2013, đã thu thập tại 5 tỉnh gồm: Thừa Thiên Huế, Quảng Trị, Hà Tĩnh, Nghệ An và Thanh Hoá được 14 nhóm loài cây trồng có nguồn gốc địa phương với tổng số 355 mẫu nguồn gen, bảo tồn, lưu giữ 585 mẫu nguồn gen. Trong đó lưu giữ tại Trung tâm Nghiên cứu cây ăn quả và cây công nghiệp Phủ Quỳ (Trung tâm Nghiên cứu CAQ và CCN Phủ Quỳ) ở ngoài đồng ruộng 244 mẫu, trong nhà lưới 154 mẫu và lưu giữ tại Trung tâm Tài nguyên Thực vật ở ngoài đồng ruộng 38 mẫu nhóm cây có củ, lưu giữ kho lạnh 149 mẫu nguồn gen loài cây có hạt; Mô tả, đánh giá 318 lượt mẫu nguồn gen; Cấp phát 125 lượt mẫu nguồn gen cây ăn quả có múi phục vụ công tác nghiên cứu và phát triển sản xuất cho bà con nông dân vùng Bắc Trung bộ.