ISSN 1859-1558
TẠP CHÍ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM
Journal of Vietnam Agricultural Science and Technology
VIỆN KHOA HỌC NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM

NGHIÊN CỨU CƠ CHẾ TIẾN HÓA CỦA HỌ GENE MÃ HÓA TIỂU PHẦN NUCLEAR FACTOR-YA Ở CAM NGỌT (Citrus sinensis)

Các Tác giả

Chu Đức Hà, La Việt Hồng, Nguyễn Ngọc Huyền

Từ khóa

Cam ngọt, Citrus sinensis, tiến hóa, Nuclear factor-YA, tin sinh học

Tóm tắt

Trong nghiên cứu này, cơ chế tiến hóa và nhân rộng của họ gen mã hóa tiểu phần yếu tố nhân-YA (NF-YA) đã được phân tích trên hệ gen cam ngọt (Citrus sinensis). Trong số 6 gen CsNF-YA, 1 cặp gen lặp, CsNF-YA3 và CsNFYA6 đã được xác định với mức tương đồng ở cấp độ nucleotit đạt 57,6%. Sự kiện gen lặp này xuất phát từ 2 nhiễm sắc thể chứng tỏ hiện tượng lặp gen trên các nhiễm sắc thể khác nhau có thể là nguyên nhân chính để giải thích cho sự nhân rộng của họ gen CsNF-YA ở cam ngọt. Tính toán giá trị Ka/Ks cho thấy chọn lọc tự nhiên đã kìm hãm đột biến điểm xảy ra trên cặp gen lặp nhằm giữ nguyên vẹn cấu trúc gen trong suốt 54,75 triệu năm trước. Phân tích cấu trúc protein đã xác định được 1 đoạn tương đồng chung nằm trong vùng chức năng của họ NF-YA ở thực vật, trong khi 4 đoạn tương đồng còn lại được dự đoán có thể đặc trưng cho họ NF-YA ở cam ngọt.

Đã xuất bản

28/02/2018

Cách trích dẫn

Lĩnh vực

Số thường kỳ