Công tác chọn tạo giống, thu thập và bảo tồn nguồn gen nhãn đến nay vẫn còn một số hạn chế do việc xác định giống nhãn chủ yếu dựa trên mô tả các đặc tính hình thái. Để khắc phục tồn tại đó, nghiên cứu phân tích đa dạng di truyền được thực hiện nhằm xác định nguồn gen còn thiếu và trùng lắp trong thu thập và bảo tồn nguồn gen nhãn. Hai mươi tám chỉ thị SSRs được chọn lọc từ các chỉ thị SSRs của hệ gen cây vải được sử dụng để xác định tính đa dạng di truyền của 44 giống/dòng nhãn, vải được thu thập, bảo tồn và các dòng nhãn lai có triển vọng tại Viện Cây ăn quả miền Nam. Kết quả cho thấy có 81 đoạn DNA được nhân và phát hiện bằng 28 chỉ thị SSRs với trung bình 2,9 allen/SSR, PIC trung bình là 0,46. Phân tích đặc tính phân tử cho thấy có 28 cấu hình di truyền khác nhau. Hai giống nhãn Bảy Tô và nhãn Sóc Trăng có mối quan hệ di truyền rất gần, hai dòng lai T87 và T160 gần như tương tự nhau, nghiên cứu này là nền tảng xác định tính đa dạng di truyền của các giống nhãn thu thập và các dòng nhãn lai triển vọng