ISSN 1859-1558
TẠP CHÍ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM
Journal of Vietnam Agricultural Science and Technology
VIỆN KHOA HỌC NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM

XÂY DỰNG QUY TRÌNH CHẨN ĐOÁN East Asian Passiflora virus GÂY BỆNH TRÊN CHANH DÂY (Passiflora edulis Sims) BẰNG REAL-TIME PCR

Các Tác giả

Huỳnh Nguyễn Minh Nghĩa, Nguyễn Đăng Quân, Nguyễn Xuân Dũng

Từ khóa

RT-PCR, chanh dây, East Asian Passiflora virus, gen mã hóa protein vỏ

Tóm tắt

East Asian Passiflora virus (EAPV) là một trong ba loại virus gây bệnh hóa bần vỏ trái ảnh hưởng nghiêm trọng đến năng suất và chất lượng chanh dây. Để kiểm soát hiệu quả bệnh này cần phát hiện sớm và chính xác sự hiện diện của virus trên cây. Nghiên cứu này thiết lập quy trình phản ứng chuỗi polymerase thời gian thực (real-time polymerase chain reaction, RT-PCR) phát hiện virus từ mô lá chanh dây nhiễm bệnh. Phân đoạn gen mã hóa protein vỏ của virus được khuếch đại bằng phản ứng RT-PCR, tách dòng và kiểm chứng bằng phân tích trình tự trước khi thiết lập phản ứng RT-PCR. Ngưỡng phát hiện (LOD) và giới hạn định lượng (LOQ) của phản ứng khuếch đại cũng được xác định. Kết quả cho thấy phản ứng RT-PCR đã khuếch đại được phân đoạn gen (188 bp) tương đồng trên mức 90% so với các trình tự gen đã công bố của virus EAPV. Phản ứng RT-PCR có phương trình đường chuẩn dạng y = –3,3346x + 40,924 với hệ số tương quan R2 = 0,9903. Ngưỡng phát hiện và giới hạn định lượng của phản ứng đạt mức tương ứng 100 và 1.000 bản sao/µL. Các mẫu chanh dây thu thập bị nhiễm virus với số lượng dao động từ 105 đến 107 copies/µL.

Đã xuất bản

28/10/2021

Cách trích dẫn

Lĩnh vực

Số thường kỳ