Bệnh đạo ôn lúa (Magnaporthe oryzae) gây ra những thiệt hại nghiêm trọng cho sản xuất lúa trên thế giới và Việt Nam. Để phát triển giống lúa kháng đạo ôn hiệu quả và bền vững, cần có hiểu biết sâu rộng về đa dạng di truyền và sự tiến hóa của quần thể nấm M. oryzae trong một vùng sinh thái cụ thể. Nghiên cứu này đã áp dụng phương pháp thu thập và phân lập mẫu nấm đạo ôn trên diện rộng, bao phủ 5 trong 7 vùng sinh thái nông nghiệp, gồm: Trung du miền núi phía Bắc và đồng bằng sông Hồng thuộc khu vực miền Bắc; Bắc Trung Bộ, Duyên hải Nam Trung Bộ và Tây Nguyên thuộc khu vực miền Trung, nhằm phục vụ nghiên cứu đa dạng di truyền của quần thể nấm đạo ôn. Kết quả đã thu thập được 214 mẫu bệnh từ 39 tỉnh, với số mẫu ở miền Bắc là 148 và miền Trung là 66. Dựa vào đặc điểm hình thái bào tử nấm đã phân lập được 945 isolates từ 124 mẫu trong tổng số 214 mẫu thu thập. Các isolates được tách chiết ADN và được xác định là nấm M. oryzae dựa trên cặp mồi ITS5/ITS4. Bộ chủng nấm M. oryzae được bảo quản dưới dạng sợi nấm trên giấy thấm ở –20°C và ADN, là vật liệu khởi đầu cho các nghiên cứu di truyền của quần thể nấm đạo ôn.